Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms