Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc7Q9D0M0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc7Q9D0M0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc7Q9D0M0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc7Q9D0M0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc7Q9D0M0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc7Q9D0M0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc7Q9D0M0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc7Q9D0M0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms