Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms