Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpnQ9CZW2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms