Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ssu72Q9CY97 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms