Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms