Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed5Q9CXE7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms