Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms