Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Sycp2Q9CUU3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms