Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms