Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl20Q9CQL4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl20Q9CQL4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms