Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms