Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQF4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQF4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms