Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms