Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp2Q9CQ73 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms