Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ11

2010109I03Rik, RIKEN cDNA 2010109I03, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109I03RikQ9CQ11 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
2010109I03RikQ9CQ11 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
2010109I03RikQ9CQ11 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms