Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms