Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scd3Q99PL7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms