Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rrbp1Q99PL5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms