Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcg5Q99PE8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms