Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem2Q99NH8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms