Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Bco2Q99NF1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Bco2Q99NF1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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