Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rnf17Q99MV7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms