Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms