Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp5lQ99LH9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
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