Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms