Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms