Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ciao1Q99KN2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms