Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms