Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms