Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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