Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctu1Q99J10 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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