Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rtn4ip1Q924D0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms