Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tdrd3Q91W18 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms