Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms