Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms