Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms