Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med17Q8VCD5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med17Q8VCD5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms