Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms