Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CipcQ8R0W1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms