Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sumf1Q8R0F3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sumf1Q8R0F3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sumf1Q8R0F3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sumf1Q8R0F3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sumf1Q8R0F3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sumf1Q8R0F3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sumf1Q8R0F3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sumf1Q8R0F3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sumf1Q8R0F3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms