Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms