Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms