Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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FgbQ8K0E8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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FgbQ8K0E8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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FgbQ8K0E8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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FgbQ8K0E8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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FgbQ8K0E8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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