Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Lrit1Q8K099 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Lrit1Q8K099 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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