Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d5Q8JZW5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms