Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms