Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms