Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tshz3Q8CGV9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms