Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms